Jednak podczas prac budowlanych konieczne będzie czasowe zamknięcie stacji Świętokrzyska a tym samym ograniczenie ruchu pociągów. Prawdopodobnie odbywać się on będzie z dwóch stacji końcowych odpowiednio do stacji Centrum i Dworzec Gdański. Pomiędzy tymi przystankami zostanie zapewne wprowadzona komunikacja zastępcza, ale spowolni to znacznie czas przejazdu i spowoduje większy tłok w tramwajach i autobusach.
Problemów i konfliktów przy drugiej linii metra jest więcej. Ministerstwo finansów nie chce oddać części swojego dziedzińca na schody ruchome stacji Nowy Świat. Są rozbieżności co do wind przy rondach Daszyńskiego i ONZ. Nie będzie prawdopodobnie wygodnego przejścia z metra do stacji PKP Stadion.
Mieszkańcy stolicy zauważają brak postępów w pracach, które oficjalnie zaczęły się we wrześniu. Urzędnicy tłumaczą, że początek takiej inwestycji zwykle jest mało widowiskowy.