Spór o granicę dotyczy liczącego 19 km kwadratowych Zalewu Pirańskiego - akwenu wokół słoweńskiego portu Piran, dolnego odcinka rzeki Dragonja na Półwyspie Istria i niewielkich rejonów przygranicznych wokół rzeki Mura we wschodniej Słowenii.
Dwumilionowa Słowenia jest zdeterminowana w sporze o granicę, ponieważ ma dostęp do morza tylko na odcinku 40 km, podczas gdy Chorwacja ma 1 800 kilometrów wybrzeża. Słoweńcy walczą też o korytarz, którym ich statki mogłyby wypływać ma wody międzynarodowe.
Porozumienie zawarte w listopadzie ub. roku przez nową premier Chorwacji Jadrankę Kosor z premierem Słowenii Borutem Pahorem przewiduje, że spór graniczny zostanie rozwiązany w drodze arbitrażu międzynarodowego, a oba kraje podporządkują się decyzji.
Słowenia, jako jedyny kraj dawnej Jugosławii jest członkiem Unii Europejskiej. W grudniu 2008 roku zablokowała z powodu nierozwiązanego sporu granicznego negocjacje akcesyjne Chorwacji z Brukselą.
Niedzielne referendum potraktowano również jako sprawdzian popularności premiera Pahora, malejącej wskutek powolnego wychodzenia Słowenii z kryzysu.pap, em