Szlak papieski zaczyna się na olsztyńskim lotnisku w dzielnicy Dajtki, gdzie wieczorem 5 czerwca 1991 roku o godz. 19.20 wylądował helikopter z Ojcem Świętym. W ulotce promującej szlak wydanej przez urząd miasta przypomniano, że było to niezwykłe lądowanie ponieważ przestał padać deszcz, a na niebie ukazała się tęcza.
Z lotniska Jan Paweł II papamobile pojechał do budynku seminarium w sąsiedniej dzielnicy Redykajny, gdzie nocował. 6 czerwca w kaplicy seminarium już o godz. 7 rano papież wraz z klerykami odmówił Jutrznię, potem zjadł śniadanie i pojechał do szpitala dziecięcego na potkanie z jego pacjentami. Po godzinnym spotkaniu z chorymi dziećmi i pracownikami lecznicy Jan Paweł II przejechał do parku przy stadionie, gdzie przy polowym ołtarzu odprawił mszę. Na tym nabożeństwie padły często przypominane w Olsztynie słowa Jana Pawła II, który wspominając swoje pobyty wypoczynkowe w tej części Polski, powiedział, że "dziękuje Warmii za Papieża".
Ostatnim punktem pobytu Jana Pawła II w Olsztynie było spotkanie w olsztyńskiej katedrze ze świeckimi, którzy działali w organizacjach katolickich, m.in. Instytucie Kultury Chrześcijańskiej. Z katedry zamkniętym autem Jan Paweł II pojechał na lotnisko w Dajtkach i o godz. 17.05 odleciał do Włocławka.
Kolejne punkty szlaku papieskiego otwierał prezydent Olsztyna Piotr Grzymowicz.pap, ps